Infectat per un virus, el Xana, el superordinador que controla el món digital (Lyoko) vol destruir la Terra. Aelita, l'única humana virtual que habita sobre Lyoko li planta cara. Lyoko és un món virtual creat per Franz Hopper, enginyer informàtic i antic professor de l'escola Kadic, que està format per 5 territoris: la banquisa, el bosc, el desert, la muntanya i el cinquè territori. Cada un posseeix torres que són bases de dades que Xana activa per enviar virus a la Terra. Un grup de col·legials format per Yumi, Odd, Ulrich i Jeremy coneixen l'existència de Lyoko i l'amenaça que Xana representa sobre la Terra i iniciaran una doble vida: col·legials durant el dia i guerrers defensors del món durant el seu temps lliure! L'única que els pot ajudar és Aelita, i per aquest motiu l'hauran de protegir de Xana
